Meandros: computational tool for image analysis of tissues

Abstract

Este trabajo final introduce Meandros, una herramienta computacional robusta y versátil diseñada para el análisis automatizado de imágenes de tejidos biológicos. Aborda la creciente necesidad de métodos cuantitativos en la biología del desarrollo, donde las técnicas tradicionales de análisis de imágenes a menudo resultan insuficientes debido a la complejidad inherente y la variabilidad de las imágenes. Meandros supera estas limitaciones integrando modelos avanzados de aprendizaje profundo para la detección y clasificación precisa de regiones de interés (ROI). Las capacidades del software se demuestran a través de dos casos de uso distintos: el análisis de la regeneración de extremidades en axolotes y la cuantificación de la elongación en gastruloides. Meandros cuenta con una interfaz gráfica de usuario (GUI) amigable, ofreciendo una solución integral para el análisis biológico basado en imágenes. En conclusión, Meandros proporciona una plataforma integral, adaptable y eficiente para el análisis cuantitativo de imágenes, facilitando así la investigación sobre problemas biológicos complejos.