Selección in silico de proteínas antigénicas para el diseño de una vacuna contra Burkholderia Mallei mediante vacunología reversa (“Reverse Vaccinology”) y estudio de viabilidad del complejo Burkholderia Cepacia (BCC) en dispositivos médicos

Abstract

Gracias a los continuos avances biotecnológicos en materia de secuenciación, cada día puede obtenerse, con mayor facilidad, un gran número de genomas provenientes de patógenos humanos. Dicho proceso ha logrado cambiar completamente el esquema empleado en la vacunología tradicional con la implementación de la vacunología reversa (VR), la cual consiste en el estudio computacional de genomas previamente secuenciados. Este estudio permite, mediante diferentes algoritmos, predecir e identificar los antígenos más probables a ser candidatos vacunales exitosos. Estas herramientas bioinformáticas estudian parámetros tales como ubicación, estructura, flexibilidad, hidrofobicidad y diversas propiedades fisicoquímicas de las proteínas y otras macromoléculas para gestionar la lista de antígenos candidatos, de manera de realizar una selección acotada de antígenos que puedan dar una buena respuesta inmune en una vacuna. Este flujo de trabajo fue ejecutado por primera vez en Neisseria meningitidis serogrupo B y se la denominó vacunología inversa o reversa. En el presente proyecto se empleará, como propuesta principal, un flujo de trabajo bioinformático con el objeto de presentar posibles proteínas antigénicas candidatas para el desarrollo de una vacuna contra el bacilo Gram negativo Burkholderia mallei, el cual pertenece a la familia Burkholderiaceae. Con este objetivo, se utilizó la información completa del genoma de la cepa 2002734306 extraído de Burkholderia cepacia genome database <www.burkholderia.com> (Johnson et al, 2015), el cual posee un número relativamente menor de genes que el resto de las especies que componen el complejo Burkholderia cepacia (BCC), facilitando de esta forma su análisis. Este microorganismo es conocido por la enfermedad del muermo, que ataca a caballos, mulas y asnos, además se transmite a humanos, y debido a su grado de patogenicidad es considerado una grave amenaza bioterrorista (Farcy et al, 2007). Por otro lado, como segundo objetivo práctico del proyecto final de la carrera (PFI) se evaluará la viabilidad y el aislamiento de la cepa Burkholderia cepacia, teniendo en cuenta que es un microorganismo formador de biofilm, el cual le permite sobrevivir durante largos períodos de tiempo, como se ha demostrado en las contaminaciones de productos farmacéuticos, desinfectantes y dispositivos médicos.